Σας αναφέρουμε μερικά, παρ' όλο που δεν καταφέραμε να φωτογραφίσουμε παρά ελάχιστα γιατί όπως μας είπαν, και είναι φυσικό, μόνο με απόλυτη ησυχία εμφανίζονται και μπορεί να τα παρατηρήσει ο επισκέπτης.
Όμως αρκετά από αυτά τα ζωγράφισε η μαθήτρια Ιωάννα Γαρεδάκη, μέλος της ομάδας μας, και μπορείτε να τα δείτε σε ζωγραφιά
Ενα από τα σημαντικότερα ζώα της πανίδας του φαραγγιού, είναι ο πασίγνωστος Κρητικός αίγαγρος ή αγρίμι που πολλές φορές κυνηγημένος αφήνει τις Ψηλές κορφές των Λευκών Ορέων και κατεβαίνει ως το φαράγγι της Αγίας Ειρήνης.
Ψηλά ζυγιάζεται ο γυπαετός ή κοκαλάς, ένα από τα πιο σπάνια πουλιά της Ευρώπης που απειλείται με εξαφάνιση.
Ο χρυσαετός ή βιτσίλα, που καταφέραμε να φωτογραφίσουμε στην φθινοπωρινή μας επίσκεψη στο φαράγγι, είναι ένα ακόμα σπάνιο πουλί που γυροπετά στο φαράγγι. ,
Έχουμε επίσης :
 τη νυφίτσα |
το κουνάβι |
τον ασβό |
| τον
σκαντζόχοιρο |
την
πέρδικα |
το
πετροχελίδονο |
| το
σπιζαετό |
το όρνιο |
το
αγριοπερίστερο |
|
τη νυχτερίδα. |
το
δενρογάλι |
Πηγές : 1) Πλυμάκης Αντώνιος "Το φαράγγι
της Αγ. Ειρήνης" Εκδ. Δασαρχείου Χανίων
2) "Ζωολογία"
Εκδ. Εκδοτική Αθηνών
3)
Εγκυκλοπαίδια "Παπυρους-Λαρούς-Μπριτάνικα"
4)
Εφημερίδα "Χανιώτικα Νεα"